「連鎖不平衡」を含む例文一覧(27)
- 連鎖不平衡状態可視化装置、および、連鎖不平衡状態可視化方法をコンピュータに実行させるプログラム
LINKAGE DISEQUILIBRIUM STATE VISUALIZER, AND PROGRAM FOR EXECUTING LINKAGE DISEQUILIBRIUM STATE VISUALIZATION METHOD WITH COMPUTER - 特許庁 - 連鎖不平衡部位抽出装置、および、連鎖不平衡部位抽出方法をコンピュータに実行させるプログラム
LINKAGE DISEQUILIBRIUM BLOCK EXTRACTING DEVICE AND PROGRAM FOR MAKING COMPUTER EXECUTE LINKAGE DISEQUILIBRIUM BLOCK EXTRACTING METHOD - 特許庁 - ＳＮＰ間の連鎖不平衡指標値データを多元的に可視化することのできる、連鎖不平衡状態可視化装置、および、連鎖不平衡状態可視化方法をコンピュータに実行させるプログラムを提供することを課題とする。
To provide a linkage disequilibrium state visualizer which can plurally visualize linkage disequilibrium index data between SNPs, and to provide a program which can perform a linkage disequilibrium state visualization method with a computer. - 特許庁 - 連鎖不平衡が強い領域において無駄なＳＮＰをタイピングすることを避けること。
To avoid typing of unnecessary SNPs in an area where linkage disequilibrium is strong. - 特許庁 - 連鎖不平衡係数がアレル頻度と累積ハプロタイプ頻度の関係で表せ、この尺度を用いることで、ハプロタイプブロックの決定が効率的に行える対応を可能とする。
To attain measures to efficiently determine a haplotype block by expressing linkage disequilibrium coefficients with the relation of allele frequency and cumulative haplotype frequency, and using the relation scale. - 特許庁 - 連鎖不平衡の強い領域において、任意数のハプロタイプを識別する最小ＳＮＰｓセット（ｈｔＳＮＰｓ）を決定するために、類似性の行列の固有方程式を解く多次元尺度法の考えを利用した。
Ideas of multidimensional scaling for solving an characteristic equation of the matrix of similarity are utilized in order to determine the smallest SNPs set (htSNPs) discriminating the arbitrary number of haplotypes in the area where linkage disequilibrium is strong. - 特許庁 - 連鎖不平衡解析等を行うプログラムに対する遺伝子型データの入力の際に、予め特定のエラー原因を除去しておくためのデータ入力支援システムを提供する。
To provide a data input support system for preliminarily removing any specific error factor when genotype data for a program for carrying out linkage disequilibrium analysis are input. - 特許庁 - 個人の多座位の遺伝子型データの集合を用いて、連鎖不平衡指標計算装置２０が、特定の２座位を含む可能な多座位の遺伝子型データを作成する。
A linkage disequilibrium index computation device 20 generates possible multi-locus genotype data including two specific loci from a set of multi-locus genotype data of individuals. - 特許庁 - ミオシンIXA（MYO9A）遺伝子上に存在する塩基の一塩基多型または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいてメタボリック症候群を検査する。
The method for examining the metabolic syndrome includes analyzing the single base polymorphism of a base existing on myosin IXA (MO9A) gene or the single base polymorphism of a base in linkage disequilibrium to the base and then examining the metabolic syndrome on the basis of the analysis result. - 特許庁 - 前記一塩基多型が、特定の塩基配列の塩基番号６１番目の塩基に相当する塩基、または該塩基と連鎖不平衡の関係にある塩基における多型である方法。
The single nucleotide polymorphism is a polymorphism in a base corresponding to the base 61 of a specific base sequence or a base in relation of linkage disequilibrium with the base. - 特許庁 - IBTK遺伝子上に存在する塩基、または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいて免疫疾患を検査する。
The examination method comprises analyzing the single nucleotide polymorphism of a base existing on IBTK gene or a base in linkage disequilibrium to the base, and then examining an immunological disease on the basis of the analysis result. - 特許庁 - GLYPICAN-5遺伝子上に存在する塩基の一塩基多型または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいてネフローゼ症候群を検査する。
The single nucleotide polymorphism of a base existing on a GLYPICAN-5 gene, or the single nucleotide polymorphism of a base in linkage disequilibrium to the base is analyzed, and the nephrotic syndrome is examined based on the analysis result. - 特許庁 - MKKS（McKusick-Kaufman syndrome ）遺伝子上の特定の位置に存在する、ｒｓ１５４７の一塩基多型、または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいてメタボリック症候群を検査する方法。
The method for examining the metabolic syndrome includes analyzing the single base polymorphism of rs1547, existing at a specific position on MKKS (McKusick-Kaufman syndrome) gene, or the single base polymorphism of a base in linkage disequilibrium to the base and then examining the metabolic syndrome on the basis of the analysis result. - 特許庁 - これらの多型を含む連鎖不平衡ブロックの塩基配列の中、３個のタグSNPと１個の非同義SNPが脳梗塞に関連し、特にCELSR1のrs6007897（A→G,Thr2268Ala）及びCELSR1のrs4044210（A→G,Ile2107Val）については、アミノ酸置換を伴う重要なSNPであった。
Three tag SNPs and one nonsynonymous SNP among the base sequences of linkage disequilibrium blocks including the polymorphisms are associated with cerebral infarction, and especially, rs6007897 (A→G, Thr2268Ala) of CELSR1 and rs4044210 (A→G, Ile2107Val) of CELSR1 are important SNPs accompanying amino acid substitution. - 特許庁 - CD244遺伝子上に存在する塩基の一塩基多型または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいて自己免疫疾患を検査する。
The single nucleotide polymorphism of a base on CD244 gene or of a base in chain nonequilibrium with the above base is analyzed, and based on the analysis, an autoimmune disease is examined. - 特許庁 - 本発明は、ゲノムワイドに設定したマイクロサテライトマーカーを用いて関連分析を行い関連の認められる領域を狭め、さらにその領域において特に強い関連を示すＳＮＰマーカーを設定し、該ＳＮＰマーカーおよび特に強い関連を示した前記マイクロサテライトマーカーについて連鎖不平衡を解析しこれらの多型の連鎖不平衡を解析することで、ナルコレプシー関連遺伝子を同定する。
This narcolepsy-related gene is identified by performing a relation analysis by using a microsatellite marker set up as genome wide for narrowing the region recognized to have the relation, setting up an SNP (single nucleotide polymorphism) marker showing an especially strong relation in that region and analyzing linkage disequilibrium on the SNP marker and the microsatellite marker showing the especially strong relation to analyze these polymorphic linkage disequilibrium. - 特許庁 - 抗てんかん薬がカルバマゼピンであり、ＨＬＡ−Ａアレルの遺伝子型を分析することにより前記一塩基多型が分析され、ＨＬＡ−Ａ*３１０１と連鎖不平衡の関係にある一塩基多型を含む１０塩基以上の配列、又はその相補配列を分析する方法。
In the analysis method, the antiepileptic drug is carbamazepine, the single nucleotide polymorphism is analysed by analysing the genotype of HLA-A allele, and sequences of ten or more bases including the single nucleotide polymorphism in linkage disequilibrium with HLA-A*3101 or its complementary sequence is analysed. - 特許庁 - ヒトマイトジェン活性化プロテインキナーゼ活性化プロテインキナーゼ3（MAPKAPK3）遺伝子領域に存在する特定の遺伝子多型、および該多型と連鎖不平衡の関係にある遺伝子多型を検出し得るポリヌクレオチドを含有する、I型IFNによる治療に対する感受性予測用試薬。
An I-type IFN therapy sensitivity-predictive reagent is provided, which contains a polynucleotide detecting a specific gene polymorphism present in a human mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase (MAPKAPK 3) gene region and a gene polymorphism chain nonequilibrium-related to the above polymorphism. - 特許庁 - イノシトール１，４，５−三リン酸 ３−キナーゼＣ（ITPKC）遺伝子のイントロン１の第９番目の塩基の一塩基多型または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいて川崎病を検査する。
The Kawasaki disease is examined by assaying single nucleotide polymorphism of the ninth base of intron 1 of inositol 1, 4, 5-trisphosphate 3-kinase C (ITPKC) gene or single nucleotide polymorphism of a base in linkage disequilibrium with the base and based on the result of the assay. - 特許庁 - 各種のＳＮＰに関する情報に基づいて、疾患関連解析または連鎖不平衡解析を目的としたデータ解析処理を実行する、ＳＮＰ情報データ処理装置、および、ＳＮＰ情報データ処理方法をコンピュータに実行させるプログラムを提供することを課題とする。
To provide an SNP information data processor for executing data analysis processing aiming at disease relevance analysis or linkage disequilibrium analysis on the basis of information related with various SNP and a program for making a computer execute an SNP information data processing method. - 特許庁 - ヒトインターフェロンλ2（IFNλ2）又はインターフェロンλ3（IFNλ3）遺伝子領域に存在する特定の遺伝子多型、および該多型と連鎖不平衡の関係にある遺伝子多型を検出し得るポリヌクレオチドを含有する、I型IFNによる治療に対する感受性予測用試薬。
A reagent for predicting sensitivity to the therapy with I-type IFN, containing a polynucleotide able to detect specific gene polymorphism presenting in a gene zone of human interferon λ2 (IFN-λ2) or interferon λ3 (IFN-λ3) and gene polymorphism having relation of linkage disequilibrium with the polymorphism is provided. - 特許庁 - アンジオテンシンIIタイプI受容体遺伝子上の、特定塩基配列の塩基番号５１番目の塩基に相当する塩基の一塩基多型または該塩基と連鎖不平衡にある塩基の一塩基多型を分析し、該分析結果に基づいて非アルコール性脂肪肝障害を検査する。
A single nucleotide polymorphism of a base corresponding to the 51st base of a specific base sequence on an angiotensin II type I receptor gene or a single nucleotide polymorphism of a base of the state of linkage disequilibrium with the above base is analyzed and the non-alcoholic fatty liver disorder is examined based on the analytic result. - 特許庁 - 被験者から得た生物学的試料を分析し、オレキシン１受容体遺伝子の多型であって、特定配列における一塩基多型、及び／又は前記一塩基多型と連鎖不平衡にある少なくとも１つの多型を決定する。
This method for predicting whether the subject has the predisposition of the polydipsia or not is characterized by analyzing a biological reagent obtained from a subject to determine the polymorphism of an ohlexin 1 receptor gene, wherein the polymorphism is a monobasic polymorphism at a specific sequence and/or at least one polymorphism non-equivalent to the monobasic polymorphism. - 特許庁 - 再解析により連鎖不平衡のある領域が250 kbであり、その中のマイクロサテライトマーカーは椎骨数を増大させるアリルを持つ個体において著しく多様性が小さいこと、また、椎骨数の違いがこの領域に存在するNR6A1の１アミノ酸置換によって生じることを明らかにした。
It has been found by reanalysis that the size of the region having the chain unbalance is 250 kb, the microsatellite marker in the region has remarkably small polymorphism in an individual having an allele to increase the number of vertebrae, and the difference in the vertebral number is caused by the single amino acid substitution of NR6A1 in the region. - 特許庁 - SJ819からSJ273の範囲をQTL候補領域とし、BAC整列地図を作製し、高密度に配置したマイクロサテライトマーカーを用いて椎骨数との連鎖不平衡のあるゲノム領域を検索し、見いだした領域の近傍（650 kb）の塩基配列を決定し、すべてのVNTR型の多型マーカーを抽出した。
A BAC alignment map is prepared by using a range from SJ819 to SJ273 as a QLT candidate region, a genome region having a chain unbalance to the vertebral number is searched by using a microsatellite marker arranged in high density, the base sequence near (650 kb) of the found region is determined, and all VNTR-type polymorphic markers are extracted. - 特許庁 - （Ａ１）ヒト染色体１ｑ３２において、ＮＣＢＩのＳＮＰデータベースのリファレンス番号ｒｓ１６８５６１３９、ｒｓ８２３１２８、ｒｓ８２３１２２、ｒｓ９４７２１１、ｒｓ８２３１５６、ｒｓ７０８７３０およびｒｓ１１２４０５７２の少なくとも一つで特定されるＳＮＰ（Ａ２）ヒト染色体１ｑ３２において、前記（Ａ１）のいずれかのＳＮＰと連鎖不平衡にあるＳＮＰ
In the (A1) human chromosome 1q32, in the SNP (A2) human chromosome 1q32 specified as one of reference numbers rs16856139, rs823128, rs823122, rs947211, rs823156, rs708730 and rs11240572 in the SNP database of NCBI, the SNP is in the state of linkage disequilibrium with any SNP in the (A1). - 特許庁 - 疾患感受性遺伝子座の同定方法は、病因遺伝子を含む領域から適切な間隔にある複数個の１塩基多型を選択し、上記選択塩基多型間の連鎖不平衡の程度を算出し、更に上記選択塩基多型を用いてハプロタイプを構築して、ハプロタイプ頻度に基づいて疾患感受性遺伝子座を同定することからなる。
In the identification of disease-sensitive gene loci, a plurality of single nucleotide polymorphisms are selected at a proper interval from the pathogenic gene-including area to calculate the degree of linkage disequilibrium between these selected single nucleotide polymorphism and to construct the haplotype by using the selected single nucleotide polymorphism whereby the loci of disease-sensitive gene is identified on the basis of the haplotype frequency. - 特許庁
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