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UPGMA

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UPGMA

出典:『Wikipedia』 (2011/06/13 02:53 UTC 版)

英語による解説

ウィキペディア英語版からの引用
引用

UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) is a simple agglomerative or hierarchical clustering method used in bioinformatics for the creation of phenetic trees (phenograms). UPGMA assumes a constant rate of evolution (molecular clock hypothesis), and is not a well-regarded method for inferring relationships unless this assumption has been tested and justified for the data set being used. UPGMA was initially designed for use in protein electrophoresis studies, but is currently most often used to produce guide trees for more sophisticated phylogenetic reconstruction algorithms.

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